V biofarmaceutickom následnom spracovaní je štádium zberu bunkovej kultúry jedným z najkritickejších bodov, v ktorom je stabilita proteínu náchylná na narušenie. Mechanické šmykové napätie generované a Biofarmaceutická odstredivka počas vysokorýchlostnej rotácie, v kombinácii s lokalizovaným zvýšením teploty, penovými rozhraniami a fluktuáciami pH, to všetko môže vyvolať ireverzibilnú proteínovú agregáciu cieľového proteínu.
Agregáty nielen priamo znižujú výťažok produktu – čo je ešte kritickejšie, proteínové agregáty nesú potenciálnu imunogenicitu, ktorá môže u pacientov spustiť reakcie protilátok proti liečivám (ADA), čo predstavuje významné bezpečnostné riziko. FDA aj EMA vo svojich biologických predpisoch výslovne vyžadujú prísnu kontrolu hladín agregátov. V tomto kontexte je systematická optimalizácia podmienok centrifúgy základným prostriedkom ochrany proteínovej štrukturálnej integrity a splnenia noriem kvality GMP.
RCF (Relative Centrifugal Force) je kľúčovým parametrom, ktorý riadi účinnosť sedimentácie buniek a odpadu. Avšak nadmerne vysoká RCF je tiež hlavnou hnacou silou agregácie proteínov. V podmienkach vysokého RCF prekračuje hydrodynamický strih proteínových molekúl ich prah štrukturálnej stability, odhaľuje hydrofóbne oblasti a zvyšuje intermolekulárne interakcie, v konečnom dôsledku vytvára ireverzibilné agregáty.
Pri zbere kultivačnej tekutiny buniek CHO (bunky vaječníkov čínskeho škrečka) priemyselná prax zvyčajne odporúča udržiavať RCF v rozsahu 500 – 2 000 x g na počiatočné vyčírenie. Pre fermentačné bujóny s vysokou hustotou alebo vzorky obsahujúce veľké množstvo bunkového odpadu možno použiť dvojkrokovú stratégiu odstreďovania: prvý krok používa nižšiu RCF (približne 300 – 500 x g) na odstránenie intaktných buniek, zatiaľ čo druhý krok používa vyššiu RCF (1 000 – 3 000 x g) na odstránenie bunkového odpadu. Týmto prístupom sa dosiahne požadované vyčírenie pri minimalizácii kumulatívneho šmykového napätia pôsobiaceho na proteín.
Teplota je najpriamejším fyzikálnym faktorom ovplyvňujúcim konformačnú stabilitu proteínu. Počas prevádzky a Biofarmaceutická odstredivka Teplo generované motorom a mechanické trenie spôsobujú zvýšenie teploty vo vnútri komory rotora. Bez aktívneho riadenia môže teplota vzorky počas centrifugácie nakrátko prekročiť hranicu tepelnej stability proteínu, čím sa urýchli nástup agregácie.
Optimalizácia procesu by sa mala zamerať na udržiavanie teploty počas centrifugácie pri 2–8 °C, čo je v súlade s nízkoteplotnými podmienkami následných krokov chromatografického čistenia. Priemyselné biofarmaceutické centrifúgy vybavené aktívnym chladiacim systémom môžu dosiahnuť presnú reguláciu teploty v komore v uzavretej slučke. Počas vývoja procesu by mala byť teplota topenia (Tm) cieľového proteínu určená diferenciálnou skenovacou kalorimetriou (DSC) a ako bezpečná horná hranica teploty odstreďovania by sa mala použiť hodnota aspoň o 20 °C nižšia ako Tm.
Počas fáz centrifugácie Ramp-up a Ramp-down existuje medzi kvapalinou a rotorom relatívny pohyb, ktorý generuje turbulentný šmyk, ktorý predstavuje skrytý rizikový faktor pre agregáciu proteínov – faktor, ktorý sa pri vývoji procesu často prehliada.
Príliš rýchle zrýchlenie bráni vzorkovej kvapaline v synchronizácii s rotáciou rotora, čo spôsobuje intenzívne rušenie tekutiny. Príliš prudké brzdenie naruší už sedimentované bunkové vrstvy, čo spôsobí, že Bunkové zvyšky sa resuspendujú a dostanú sa do kontaktu s cieľovým proteínom v supernatante, čím sa spustí agregácia vyvolaná rozhraním.
Stratégiou optimalizácie je naprogramovať rýchlosti zrýchlenia a spomalenia Biofarmaceutická odstredivka postupným spôsobom. Odporúča sa pomalý rozbeh (približne 50 – 100 otáčok za minútu/s) a režim jemného brzdenia, najmä pri spracovávaní liekových látok s vysokou koncentráciou protilátok alebo fúznych proteínov citlivých na strih. Za takýchto podmienok by sa čas rozbehu a brzdenia mal predĺžiť aspoň na 3–5 minút.
Agregačné správanie proteínov je úzko spojené s pH roztoku. Keď sa pH blíži k izoelektrickému bodu (pI) cieľového proteínu, čistý náboj proteínu sa blíži k nule, medzimolekulárne elektrostatické odpudzovanie sa oslabuje, dominuje hydrofóbna interakcia a výrazne sa zvyšuje tendencia k agregácii.
Úprava pH kultivačnej tekutiny pred zberom tak, aby sa odchýlila od hodnoty pI aspoň o 1–2 jednotky pH, je účinnou stratégiou na zníženie rizika agregácie. Okrem toho pridanie nízkych koncentrácií stabilizačných činidiel, ako je Polysorbát 80 alebo Arginín, do zberného pufra môže inhibovať nukleáciu agregátov a rast kompetitívnym obsadzovaním hydrofóbnych povrchových miest na molekule proteínu.
Úprava pH pred odstreďovaním by sa mala vykonávať pomaly za podmienok jemného miešania, aby sa zabránilo prechodnej agregácii spôsobenej lokalizovaným prekyslením alebo nadmernou alkalizáciou.
Pri použití odstredivky s kontinuálnym prietokom na zber v priemyselnom meradle určuje rýchlosť podávania priamo čas zotrvania vzorky v komore odstredivky a úroveň šmyku, ktorému je vystavená. Príliš vysoký prietok má za následok nedostatočnú sedimentáciu buniek a nečistôt – čo vedie k neštandardnému vyčíreniu – a súčasne vytvára vysokorýchlostný prúdový strih v distribútoroch a výstupných portoch, čo vedie k agregácii proteínov.
Optimalizácia procesu by mala uplatňovať prístup návrhu experimentu (DoE), aby sa systematicky vyhodnotil vzťah medzi rýchlosťou podávania a výkonom čistenia, ako aj agregovanými úrovňami a aby sa vytvoril operačný priestor návrhu. Predfiltrácia kultivačnej tekutiny pred podávaním - na odstránenie veľkých bunkových zhlukov - môže účinne znížiť narušenie tekutiny v komore odstredivky a chrániť štrukturálnu integritu proteínu.
Zavedenie rámca Process Analytical Technology (PAT) posunulo optimalizáciu procesov a Biofarmaceutická odstredivka od skúseností založených na dátach. Inline Turbidimeter dokáže monitorovať kvalitu vyčírenia výtoku z centrifúgy v reálnom čase a automaticky spúšťa úpravy parametrov, keď zákal abnormálne stúpa. Inline sonda Dynamic Light Scattering (DLS) dokáže priamo detegovať distribúciu veľkosti častíc agregátov nanometrov v zberovej kvapaline v reálnom čase, čím poskytuje okamžitú spätnú väzbu kvality pre zväčšenie procesu.
Integráciou systémov zberu a analýzy údajov (SCADA/DCS) na koreláciu parametrov centrifúgy – vrátane rýchlosti, teploty, prietoku a vibrácií – s atribútmi kritickej kvality proteínu (CQA) je možné vytvoriť stratégiu prediktívneho riadenia, aby sa zásadne zabránilo variáciám medzi jednotlivými dávkami v agregácii proteínov.